St Francis' College 在关心同学的学业之际亦十分希望同学要有均衡的发展，故设有大量的社团及学会给学员在课余时参加，而这些学会及团体更是由同学们自己成立和共同管理的，大部份的活动与聚会均会在午饭时间、放学以后及周末进行。它们包括有美术及陶瓷学会、歌咏团、游泳、健身、跳弹床、辩论、图书管理、戏剧、舞蹈等等。另外，学生又可以参与年轻企业计划，学习成立并管理他们自己的公司。学校亦有爱丁堡公爵奖励计划，非常受学员欢迎。学校经常利用假期组织学生到欧洲大陆旅游。而小学方面，校方亦有为小学生设立了多个学会，包括牧童笛班及各类型的兴趣班。他们亦会有自己的运动会，以及很多同学参加的管弦乐团。